V části Ochrana zvířat jsou vyučovány požadavky pohody jednotlivých druhů zvířat, jejich zabezpečování, dozor nad dodržováním těchto podmínek, postupy šetření jejich porušování a postihy. Obsahem praktické výuky je také řešení velkého množství skutečných nebo modelových případů z praxe. Cílem části Etologie je seznámit studenty s vědeckým popisem a výkladem chování živočichů, v rozsahu vhodném pro veterináře. V praktické výuce se učí základům kvantifikace a hodnocení projevů chování zvířat zájmových i hospodářských, diagnostiky a prevence poruch chování u prasat, přežvýkavců a drůbeže.