Antagonismus (amenzalismus)

Opakem syntrofismu je antagonismus (amenzalismus), při němž jeden druh působí nepříznivě na jiné druhy, tento vztah je mezi mikroorganismy velmi rozšířený. Je způsoben rychlým využitím určitých živin mikroorganismem, změnou fyzikálně chemických vlastností prostředí (pH, Eh), nahromaděním produktů metabolismu, atd.

Příklady:
  • bakterie mléčného kvašení okyselením prostředí působí antagonisticky vůči hnilobným bakteriím
  • produkce antibiotik bakteriemi a jejich účinek i v malých dávkách na citlivé mikroorganismy (antibiosa)