Buněčná stěna a cytoplasmatická membrána

Unikátní složkou buněčné stěny bakterií je peptidoglykan (mukopeptid, murein).

Peptidoglykan je polysacharid, tedy lineární polymer dvou pravidelně se střídajících aminocukrů: N-acetylglukosaminu a kyseliny N-acetylmuramové, které jsou navzájem spojeny β-1-4-vazbami. Tyto vazby jsou hydrolyzovány lysozymem.

Na karboxylovou skupinu kyseliny N-acetylmuramové jsou napojeny tetrapeptidové postranní řetězce. Typickou kombinací tetrapeptidů je L-alanin-D-glutamová kyselina-variabilní aminokyselina-D-alanin. Variabilní aminokyselinou je nejčastěji L-lysin u grampozitivních bakterií nebo L,L-diaminopimelová kyselina (DAP) u gramnegativních bakterií.

Jednotlivé tetrapeptidové řetízky jsou vzájemně propojeny, a to dvojím způsobem (jedná se o tzv. transpeptidaci). U gramnegativních bakterií a některých grampozitivních bacilů je přímo spojen koncový D-alanin jednoho tetrapeptidu s předposlední DAP druhého tetrapeptidu. V případě ostatních grampozitivních bakterií je spojení umožněno obvykle pentapeptidovým řetězcem (tzv. příčné můstky).