Taxonomie prokaryot

V mikrobiologické praxi se velmi často používá další typ vnitrodruhového třídění, tzv. variety. Jednotlivé variety jsou založeny pouze na vybraných „užitečných“ znacích, avšak neprokazatelných pomocí příbuznosti DNA. Variety jsou tedy skupiny kmenů daného druhu, které se rozlišují na základě speciálních charakteristik.

Variety, narozdíl od poddruhů, nemají v taxonomii oficiální postavení a jsou užitečné pouze z praktického hlediska.

Názvy variet obsahují příponu –var nebo –typ (používanější, ale méně správné označení). Třídění na úrovni variet má velký význam při epidemiologických analýzách.

Příklady variet:

• sérovar – odlišení na základě antigenních vlastností (rod Salmonella, L. monocytogenes);
• biovar – odlišení na základě biochemické či fyziologické vlastnosti;
• fagovar – odlišení na základě schopnosti kmenů být lyzovány různými bakteriofágy (rod Salmonella, Listeria monocytogenes);
• patovar – odlišení na základě patogenních vlastností pro různé hostitele.

Nižší jednotky bez oficiální postavení v taxonomii - příklad: