Příprava agarózového gelu

Podle požadované koncentrace agarózového gelu (obvykle 1,5 – 3%, záleží na velikosti PCR produktu) se naváží potřebné množství agarózy a k ní přidá 0,5× koncentrovaný TBE pufr (tris-EDTA-borátový pufr).

Agaróza se rozvaří v mikrovlnné troubě,opakovaně zahřeje k varu a promíchává až do úplného rozpuštění.

Pak se nechá agaróza zchladit asi na 45 °C a poté se nalije do připravené vaničky. Do agarózy se vsune hřebínek, který se nesmí dotýkat dna vaničky a nechá se na vodorovné ploše ztuhnout při laboratorní teplotě.

Ze ztuhlého gelu se opatrně vysune hřebínek, nesmí při tom dojít k poškození gelu.