Taxonomie prokaryot

Cílem klasifikace je uspořádání organismů na základě jejich vzájemných vztahů a podobností do jednotlivých taxonů.

Prvním krokem klasifikace je experimentální stanovení vlastností mikroorganismu. Na základě výsledků analýzy jsou potom mikroorganismy zařazovány do jednotlivých skupin. Abychom tedy mohli mikroorganismy klasifikovat, musíme nejdříve znát jejich významné morfologické, biochemické, fyziologické, chemické, molekulárně-biologické a genetické charakteristiky.

Běžně používanou klasifikační metodou je numerická taxonomie, která díky využití počítačové analýzy umožňuje zpracování velkého množství dat z různých zdrojů (morfologické, biochemické, fyziologické, antigenní, atd.). Prvním krokem je shromažďování údajů pro klasifikované kmeny, jednotlivé charakteristiky jsou následně zakódovány a je vypočítána podobnost mezi kmeny. Zjištěná podobnost je závěrem analyzována za účelem vytvoření taxonomických struktur.