Taxonomie prokaryot

Identifikace je praktickou aplikací klasifikace a nomenklatury, je to proces dokazování, že nový izolát patří k jednomu již ustanovenému a pojmenovanému taxonu.

Při identifikaci bakterií se využívají klasifikační charakteristiky, identifikační schémata však nejsou totožná s klasifikačními schématy, ale mohou si být podobná.

Identifikační schéma pro skupinu mikroorganismů lze konstruovat až po tom, kdy byla tato skupina klasifikována.

Obecně platí, že charakteristiky zvolené pro identifikační schéma by měly být snadno stanovitelné a dále, že tato schémata obsahují pouze několik nejvýhodnějších rozlišujících charakteristik (u klasifikace velký počet). Podmínky, při nichž byly jednotlivé charakteristiky testovány by měly být standardně popsány.

Pro klasifikaci má každá zjištěná charakteristika stejnou váhu. Naproti tomu pro identifikaci mohou být některé znaky zvýhodněny oproti ostatním, a to v závislosti na identifikované skupině (např. koaguláza x stafylokoky; oxidáza x enterobakterie).