Taxonomie prokaryot

Znaky (vlastnosti) sloužící ke klasifikaci bakterií:

• morfologické (tvar a velikost buněk, přítomnost bičíků, barvitelnost, vzhled kolonií, atd.)

• fyziologické (schopnost využívat různé zdroje živin a energie, vztah ke kyslíku, složení a funkce buněčné stěny, tvorba nebo štěpení různých sloučenin, schopnost vyvolat onemocnění jistého hostitele či schopnost existence v různých typech prostředí, atd.)

• sérologické a chemické (antigenní struktura, chemické složení buněčné stěny či buněčných struktur – peptidoglykan, kyselina teichoová, polární lipidy cytoplasmatické membrány, mastné kyseliny, atd.)

• molekulární (složení bazí nukleových kyselin, tj. poměr cytosinu a guaninu k adeninu a thyminu vyjadřovaný v procentech jako obsah C+G, primární struktura DNA, atd.) 

• genetické (schopnost výměny genů transformací, transdukcí nebo konjugací)