Energetický metabolismus chemoorganotrofních bakterií

Katabolismus chemoorganotrofních bakterií má tři varianty – fermentaci, aerobní respiraci a anaerobní respiraci. Celý cyklus uvedený na předchozím obrázku probíhá za přítomnosti kyslíku a označujeme jej tedy jako aerobní respiraci.

Na rozdíl od rostlin a živočichů jsou bakterie schopny žít chemoorganotrofně i za anaerobních podmínek. Při anaerobní respiraci je rozdíl pouze v tom, že konečným akceptorem elektronů není kyslík, ale jiná molekula, např. nitrát, který je redukovaný na nitrit.

Třetí možností je fermentace neboli kvašení, které opět probíhá za anaerobních podmínek. Při fermentaci je zdroj energie (glukosa) v průběhu katabolismu rozštěpen na dvě látky, z nichž jedna je oxidována a druhá redukována (ta funguje jako akceptor vodíku a elektronů odejmutých první látce).