Agarózová gelová elektroforéza (ELFO)

1) Připravený gel se vloží do elektroforetické vany a zalije 0,5× TBE pufrem. Celý gel musí být ponořen, hladina TBE pufru by měla být 1 – 2 mm nad gelem.

2) Druhou možností je nanášení vzorků do gelu tzv. „na sucho“ mimo elektroforetickou vanu.

Gel s nanesenými vzorky poté vložíme do elektroforetické vany a zalijeme 0,5× TBE pufrem, pufr musíme nalévat velmi opatrně, aby nedošlo k vyplavení vzorků z jamek.

Do jamek gelu se nanáší po 10 μl PCR amplifikované reakční směsi, a to jednotlivé vzorky i pozitivní a negativní kontrolu.

Pokud se nepoužívá barevná polymeráza s vkládacím pufrem, musí se před nanesením PCR produkt smíchat v poměru 1:5 s vkládacím pufrem, který obsahuje stabilizační složky a látku (barvivo) pro zviditelnění přibližné migrace DNA gelem.

Do jedné jamky gelu se nanese DNA marker.

Marker je velikostní standard, obsahující různě dlouhé fragmenty DNA s přesně definovaným počtem páru bazí. Používá se při agarózové gelové elektroforéze k odhadu velikostí PCR produktů na základě jejich pohyblivosti v agarózovém gelu.